Le technologue en imagerie médicale donnera du baryum ou un liquide de contraste à base d'iode à boire à l'enfant. Il positionnera l'enfant dans plusieurs positions soit les positions debout et couchée. Le radiologiste effectuera des images sous guidage radioscopique (procédé permettant de visualiser les organes en mouvement) pour voir l'oesophage, l'estomac et le duodénum.
Durée de l'examen pour le transit gastroduodénal: environ 20 minutes